第二季大结局中,神秘神父再度现身,协助莎拉通知约翰迅速撤离。尽管情况危急,约翰依然派遣卡梅隆前去营救母亲。经历激烈对抗后,伤痕累累的卡梅隆成功救出莎拉。莎拉随即命令她摧毁位于地下室的约翰·亨利机器,自己则前去面对凯瑟琳·韦弗(T1001液态机器人)。
正当巨型飞机撞向大楼的千钧一发之际,T1001挺身而出保护了他们,并指引众人前往地下室躲避。然而在地下室中,他们只找到卡梅隆残破的机械躯体,屏幕上一行“对不起,约翰”的字样令人心碎,约翰·亨利也已消失无踪。
韦弗透露关键信息:卡梅隆并非存在于某处,而是存在于某个时间。时空传送装置再次启动,莎拉此次选择不与约翰同行。毅然决定寻找卡梅隆的约翰,与T1001一同穿越时空前往未来。
在未来世界,尚未成为领袖的约翰无人相识。他相继遇见德雷克与自己的亲生父亲,而在旅程的终点,竟发现与卡梅隆面容完全相同的年轻女子正在轻柔抚摸着一只狗,为故事留下震撼而充满悬念的结局。