神盾局陷入前所未有的危机,特工们被迫踏上绝境求生之路。沃德在飞机上突然叛变,射杀汉德特工后救出了加勒特与蕾娜——原来加勒特正是传说中拥有预知能力的“千里眼”,其真实能力实为盗取的神盾局高级权限。此刻九头蛇势力开始全面反扑,全球政府都在追捕神盾局成员,库尔森团队陷入孤立无援的境地。
身受重创的神盾局飞机艰难维持运转,库尔森忍痛命令斯凯删除所有机密资料,准备让神盾局从此消失于世人视野。而团队成员尚不知沃德早已叛变,仍与他保持通讯。加勒特警告沃德不可因个人感情影响任务,同时揭示他解救蕾娜的真正目的:希望借助她的科学天赋,破解那种能令人起死回生的外星药物之谜。
沃德与加勒特联手攻破寒冰监狱,试图获取西蒙斯留下的研究数据,却因斯凯设置的高级加密而受阻。加勒特随即指派沃德重返库尔森团队继续潜伏。与此同时,梅特工接到富瑞局长的秘密指令登机——原来富瑞怀疑库尔森的大脑中可能被九头蛇植入了控制脉冲。
库尔森带领团队冒着严寒前往富瑞临终前传递的坐标,在冰天雪地中寻找神盾局的最后希望。经过漫长搜寻,他们终于发现了一个隐秘基地。驻守人员向他们透露了一个惊天秘密:富瑞局长其实仍然在世——这在当前形势下已成为最高机密。这个基地,将是神盾局绝地重生的最后机会。