菲尔·科尔森和他的团队追踪到了乔瑟夫的下落,对方在精神混乱的状态下透露了《黑暗之书》的埋藏地点——正是他与露西最初发现这部禁忌之书的位置。然而话音未落,乔瑟夫便七窍流血暴毙而亡。此时露西早已抢先一步找到了书,却发现上面的文字神秘消失,一无所获。
意识到《黑暗之书》带来的巨大威胁,团队就是否向神盾局局长弗瑞汇报产生分歧。他们决定首先接触唯一可能了解内情的伊莱——罗比的舅舅。然而当科尔森与梅特工前往监狱探访时,遭到已被露西感染的典狱长袭击,两人被困狱中。时间紧迫,他们必须抢在露西之前找到伊莱。
另一方面,罗比向迈克申请加入行动,黛西也为其争取机会。迈克决定全员配备冷冻枪应对可能的大规模感染,同时菲茨与西蒙斯配合拉德克里夫博士加紧研发治疗药物。行动前,菲茨将首批针剂交予迈克,团队乘昆式战机迅速抵达监狱。
迈克利用解药使典狱长等人恢复神智,然而在寻找伊莱的过程中,科尔森、梅和黛西遭遇了对异人充满敌意的囚犯群体。危机时刻,露西以气化形态现身又诡秘消失,同时所有牢门被打开,囚犯纷纷涌出将三人包围。幸亏菲茨远程开启所有出口,他们才得以脱身。
西蒙斯在接受内部评估时,因敏感问题陷入紧张。此时局长突然介入,带她参与一场与反异人政客的电视辩论准备。为争取公众支持,局长在直播中公开了自己异人的身份,凭借昔日英雄形象与政绩赢得极高支持率。但西蒙斯通过微表情分析指出其陈述中的不实之处,局长听后若有所思,终止了对她的评估。
罗比与迈克在搜寻中遭遇幽灵体攻击,迈克不幸感染却及时自我注射解药。两人最终找到伊莱,却在撤离过程中因罗比压抑不住复仇之火而让其独自登上飞行器。罗比转身处理了昔日仇人,但当团队汇合时,发现伊莱已被露西劫持上一辆救护车。
一直因林肯之故自我封闭的黛西,刻意与团队保持距离。梅直言告诉她这样的逃避毫无意义,正如从前的自己。最终在科尔森的感召下,黛西重新回归神盾局大家庭。
而在救护车中,露西将《黑暗之书》置于伊莱面前。令人震惊的是,一直无法被阅读的文字竟在伊莱眼中清晰浮现,他难以置信地睁大了双眼。